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인간의 몸 안에 공존하고 있는 미생물의 유전정보 전 체를 휴먼마이크로바이옴(Human Microbiome)이라 한 다. 마이크로바이옴에 대한 연구는 체내의 미생물이 인 체에 미치는 영향력을 밝히는 것이다. 그 때문에 이를 제 2의 유전자, 즉 세컨드 게놈(second genome)으로도 부 르고 있다. 미생물들은 다른 어떤 생명체보다도 복잡한 다양성을 보이며 지구상의 거의 모든 환경에 적응하면서 생존한다. 인체도 예외가 아니며, 대장(colon)에만도 인체의 총 세포 수보다 약 10배(1014개체)가 더 많은 수가 존재하고, 그 밖의 호흡기·귓속·위·피부 등 신체 부위에도 수많은 미생 물들이 살고 있기 때문에 건강에 직간접적으로 영향을 주 고 있다. 최근의 연구를 보면 개인 맞춤형 식이의 접근법에 대 한 관심이 높아지고 있다. 마이크로바이옴뿐만 아니라 숙 주 유래의 다양한 인자들이 식이조절에 대한 반응에 영향을 미치는 사실도 알 수 있다. 마이크로바이옴은 더 쉽게 조절이 가능하며, 식이의 소화·흡수·대사· 면역 조절에 관여함으로써 인간의 생리를 조절할 수 있다. 장내 마이크로바이옴 데이터를 분석해 보면 그 사람이 현재 즐겨 먹는 식생활 패턴이 나온다. 이를 통해 질병의 예방을 위한 건강한 유익균을 탐색하고, 좋은 원료로 배양하여 유익한 대사산물 을 만들어 인간에게 이롭고 새로운 발효식품이 탄생하게 된다. 인체내 대사시스템이 밸런스가 깨지거나 대사효소가 잘 작동하지 못하는 유전형일지라도, 유 익균(세균)은 음식을 먹고 내놓는 생물전환작용을 통해 인간에게 이로운 물질로 바꾸어 줄 수 있 기 때문에, 마이크로바이옴(microbiome)이 차세대 바이오헬스케어 산업의 고부가가치를 창출할 핵심 동력으로 주목 받고 있다.