원문정보
A Validation Study to Apply of PowerPlex®Y23 Kit in Y-STR Genotyping of Sexual Assault Samples
초록
영어
Herein, we evaluated the sensitivity and efficiency of PowerPlex®Y23 kit (PPY23 kit) in Y-STR DNA profiling by comparing the other commonly used AmpFLSTR®Y-filerTM kit (Y-filer kit). To determine the sensitivity, Amp FLSTR® Identifiler PLUS kit (ID PLUS kit) was additionally compared with two kits. In serial dilutions of single source DNA samples, full profiles using Y-filer kit and ID PLUS kit were obtained with 62.5 pg of DNA. Although PPY23 kit includes more loci than Y-filer kit and ID PLUS kit, its full and correct profile was detected with 31 pg of DNA, establishing the PPY23 kit as a sensitive method for STR testing. In male:female DNA mixtures of varying ratios, Y-filer kit generated the complete DNA profiles at 1:4,000 ratio. Under the same conditions, PPY23 kit produced the full DNA profiles at 1:20,000 ratio, suggesting the PPY23 kit as an effective kit for Y-STR profiling of male:female mixtures. Holding the input amounts of 1 ng total DNA, mixtures of two male DNA samples were examined at various ratios. All three kits produced the full DNA profiles at 1:3 and 3:1 ratios. These results suggest that PPY23 kit is more useful than Y-filer kit for Y-STR DNA profiling, especially inmale:female DNA mixtures.
한국어
성범죄에 있어 남성의 흔적을 찾기 위한 Y-STR형 분석은 다량의 여성 DNA가 오염된 시료에서 큰 의미가 있다. 최근 출시된 PowerPlex®Y23 kit (PPY23 kit)와 기존에 사용되었던 AmpFLSTR®Y-filerTM kit (Y-filer kit)의 민감도와 검출한계의 비교 및 두 제품과의 민감도 비교를 위하여 AmpFLSTR®Identifiler PLUS kit (ID PLUS kit)를 추가하 였다. 순차적으로 희석된 시료들을 이용하여 각 kit에서 전체 유전자 형이 안정적으로 확인되는 DNA 시료의 최소량을 비교한 결과, ID PLUS kit와 Y-filer kit는 0.063 ng 그 리고 PPY23 kit는 0.031 ng에서 안정적인 유전자형을 확인할 수 있는 민감성을 보였다. 다량의 여성 DNA 에 미량의 남성 DNA가 혼합된 경우, 남성 특이적인 Y-STR 유전자형을 확보할 수 있는 최대 비율(남성 DNA:여성 DNA)을 확인해 보았다. 그 결과, Y-filer kit는, 1:2,000 혹은 1:4,000까지 남성의 유전자형을 안 정적으로 확인할 수 있는 반면에 PPY23 kit는 그 보다 더 높은 비율인 1:20,000 배까지 안정적으로 남성 의 유전자형을 확보할 수 있었다. PPY23 kit의 이러한 높은 민감도는 미량의 남성 DNA에 다량의 여성 의 DNA가 혼합된 여성의 팬티나 질 내용물과 같은 현장증거물에서도 동일하게 확인되었다. 그러나, 두 남성의 DNA가 서로 혼합된 경우에는 PPY23 kit와 Y-filer kit 사이에서 민감성의 차이를 확인할 수 없었 다. 이러한 결과들은 현장 증거물에서 PPY23 kit가 Y-filer kit를 충분히 대체할 수 있을 뿐 아니라, 미량 의 DNA 시료에 대해 유용성이 높아 적용이 유용할 것으로 사료된다.
목차
Abstract
서론
재료 및 방법
결과 및 고찰
1. 3종 kit에서 최저 검출농도 비교
2. 혼성 DNA에서 남성 DNA의 검출한계
3. 두 남성의 혼합 DNA에서 혼합비율 비교
4. 혼성 DNA에서 남성 DNA의 검출한계
결론
감사의 말
참고문헌