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제주마 체중에 나타나는 환경적 변이와 유전적 변이를 조사하기 위하여 870두 경주마의 17,757 기록을 분석하였다.연도,계절,나이,성별의 고정 효과와 임의효과인 영구환경효과 및 상가적 유전 효과를 설정하여 SUR Iteration 방법으로 BLUP 해를 구하였다. 만 2세 이상 경주마로 이용된 제주마의 체중은 공통평균(μ)이 267.2kg인 것으로 분석되었다.연도 와 계절에 따른 효과는 1-2.5kg내외로 그리 크 게 나타나지는 않았다.나이에 따른 효과는 7세에 269.9kg으로 최고점을 보인 후 감소하는 경향으로 나타났으며,1990년대에 비해 2세와 3세에서 각각 55kg과 27kg이 증체된 것으로 분석되었다. 영구환경효과와 상가적 유전효과 추정치들은 정규분포상을 보이고 있었으며, 영구환경효과의 변이계수는 1.8%, 상가적 유전효과는 성체중의 5.2%로 나타난바 상가적 유전효과가 영구환경효 과에 비해 다소 큰 개체변이성을 보이고 있었다. 결과적으로 선발과 계획교배로 경주마 체중에 가 시적인 유전적 개량을 기대할 수 있는 것으로 사 료되었다.