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Population Genetics of 23 Y-Chromosomal STR Loci in South Koreans

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한국인 집단에서 23개 Y-STR 유전자좌위들에 대한 집단유전학적 분석

Seong Yeon Yoo, Songyi Han, Jung Hee Hwang, Myung Jin Park, Jeong Ah Kwon, Nam Soo Kim, Ji Hwan Park, Nam Soo Cho

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초록

영어

Haplotypes and allele frequencies of 23 Y-chromosomal STR loci included in the PowerPlex® Y23 system and the AmpFlSTR® YfilerTM kit were obtained from a sample of 301 unrelated individuals living in South Korea. The PowerPlex® Y23 system configuration contains 17 loci of the AmpFlSTR® YfilerTM kit and 6 new recommended loci (DYS576, DYS481, DYS549, DYS533, DYS570, and DYS643). A total of 300 haplotypes were observed in the 301 individuals studied, of which 299 were unique. The overall haplotype diversity for the 23 Y-STR loci was 0.99998, and the discrimination capacity was 0.99668. We found 10 atypical alleles, including null, triplicated and microvariant alleles. Especially, DYS570 19.1 allele and 19.3 (5 individuals, 1.7%) is frequently observed in our study. The concordance study made for this population data revealed no discordant allele between the kits. The results indicate that these 23 loci are useful genetic markers for forensic personal identification and paternity testing in the Korean population.

한국어

연관되지 않는 한국인 301명 대상자에 대해 PowerPlex® Y23 system (Promega) 및 AmpFlSTR® YfilerTM kit (Applied Biosystems)에 포함된 23개 Y 염색체 STR 유전자좌위들을 분석하여 하플로타입과 대립유전자 빈도 계산을 수행하였다. PowerPlex® Y23 system은 AmpFlSTR® YfilerTM kit에 포함된 17개 마커와 6개의 새로운 마커 (DYS576, DYS481, DYS549, DYS533, DYS570, DYS643)를 포함한다. 301명 에 대한 23개 Y 염색체 STR 유전자좌위들의 데이터를 분석한 결과, 300개의 하플로타입이 관찰되고, 전 체 23개 유전자좌위들에 대한 하플로타입 다양성(haplotype diversity)은 0.99998, 식별력(discrimination capacity)은 0.99668로 계산되었다. 총 10명에게서 null (1명), triplicated (2명) 및 microvariant (7명) 대립 유전자가 확인되고, 특히, DYS570 좌위는 5명(1.7%)에서 19.1 또는 19.3 microvariant 대립유전자가 관찰 되었다. 두 개의 분석 kit (AmpFlSTR® YfilerTM kit 및 PowerPlex® Y23 system)에서 불일치 결과는 확인 되지 않았다. 따라서, 본 연구에서 분석된 23개 Y-STR 유전자좌위들은 한국인 집단에서 개인 식별 및 친 자확인에 있어 유용한 마커임을 확인할 수 있었다.

목차

Abstract
 요약
 Introduction
 Methods and Materials
  1. Population samples
  2. DNA extraction and STR typing
  3. Statistical data analysis
 Results and Discussion
 Conclusion
 References
 Acknowledgements

저자정보

  • Seong Yeon Yoo 유승연. Department of Human Biological Traces, Netherlands Forensic Institute, P.O. Box 24044, 2490 AA, The Hague, The Netherlands,
  • Songyi Han 한송이. Department of Forensic Medicine, Daejeon Agency, National Forensic Service, Daejeon 305-348
  • Jung Hee Hwang 황정희. Department of Forensic Medicine, Daejeon Agency, National Forensic Service, Daejeon 305-348
  • Myung Jin Park 박명진. Forensic DNA Division, National Forensic Service, Wonju 220-170
  • Jeong Ah Kwon 권정아. Department of Forensic Medicine, Daejeon Agency, National Forensic Service, Daejeon 305-348
  • Nam Soo Kim 김남수. Department of Forensic Medicine, Daejeon Agency, National Forensic Service, Daejeon 305-348
  • Ji Hwan Park 박지환. Department of Forensic Medicine, Daejeon Agency, National Forensic Service, Daejeon 305-348
  • Nam Soo Cho 조남수. Department of Forensic Medicine, Daejeon Agency, National Forensic Service, Daejeon 305-348

참고문헌

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